Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EgfrQ01279 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EgfrQ01279 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EgfrQ01279 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EgfrQ01279 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EgfrQ01279 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EgfrQ01279 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EgfrQ01279 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EgfrQ01279 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
EgfrQ01279 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EgfrQ01279 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
EgfrQ01279 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
EgfrQ01279 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
EgfrQ01279 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EgfrQ01279 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
EgfrQ01279 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EgfrQ01279 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EgfrQ01279 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EgfrQ01279 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EgfrQ01279 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EgfrQ01279 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EgfrQ01279 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms