Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms