Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GabpaQ00422 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms