Protein–RNA interactions for Protein: Q000W5

Gbp10, Guanylate-binding protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp10Q000W5 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms