Protein–RNA interactions for Protein: P97390

Vps45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps45P97390 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vps45P97390 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vps45P97390 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Vps45P97390 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vps45P97390 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Vps45P97390 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vps45P97390 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vps45P97390 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vps45P97390 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vps45P97390 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vps45P97390 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vps45P97390 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vps45P97390 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vps45P97390 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Vps45P97390 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Vps45P97390 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vps45P97390 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vps45P97390 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vps45P97390 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vps45P97390 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vps45P97390 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vps45P97390 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vps45P97390 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vps45P97390 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vps45P97390 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Vps45P97390 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vps45P97390 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Vps45P97390 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vps45P97390 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vps45P97390 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vps45P97390 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vps45P97390 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vps45P97390 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vps45P97390 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vps45P97390 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vps45P97390 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vps45P97390 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vps45P97390 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vps45P97390 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vps45P97390 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vps45P97390 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vps45P97390 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vps45P97390 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vps45P97390 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Vps45P97390 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vps45P97390 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vps45P97390 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Vps45P97390 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vps45P97390 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vps45P97390 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Vps45P97390 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vps45P97390 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Vps45P97390 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vps45P97390 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vps45P97390 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Vps45P97390 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Vps45P97390 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vps45P97390 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vps45P97390 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vps45P97390 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vps45P97390 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vps45P97390 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vps45P97390 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vps45P97390 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vps45P97390 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vps45P97390 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vps45P97390 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vps45P97390 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Vps45P97390 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vps45P97390 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vps45P97390 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vps45P97390 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vps45P97390 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vps45P97390 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vps45P97390 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vps45P97390 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vps45P97390 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Vps45P97390 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Vps45P97390 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vps45P97390 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vps45P97390 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vps45P97390 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vps45P97390 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vps45P97390 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Vps45P97390 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vps45P97390 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vps45P97390 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Vps45P97390 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vps45P97390 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Vps45P97390 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Vps45P97390 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Vps45P97390 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vps45P97390 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vps45P97390 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Vps45P97390 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Vps45P97390 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vps45P97390 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Vps45P97390 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Vps45P97390 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vps45P97390 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms