Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Mesp1P97309 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms