Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cbx1P83917 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cbx1P83917 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
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