Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabpb2P81069 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabpb2P81069 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabpb2P81069 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabpb2P81069 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabpb2P81069 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabpb2P81069 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabpb2P81069 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabpb2P81069 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabpb2P81069 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabpb2P81069 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabpb2P81069 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabpb2P81069 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabpb2P81069 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabpb2P81069 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabpb2P81069 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabpb2P81069 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabpb2P81069 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gabpb2P81069 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gabpb2P81069 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gabpb2P81069 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gabpb2P81069 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gabpb2P81069 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gabpb2P81069 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gabpb2P81069 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gabpb2P81069 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gabpb2P81069 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gabpb2P81069 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gabpb2P81069 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gabpb2P81069 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms