Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptprn2P80560 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptprn2P80560 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptprn2P80560 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptprn2P80560 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptprn2P80560 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptprn2P80560 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptprn2P80560 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptprn2P80560 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptprn2P80560 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptprn2P80560 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptprn2P80560 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptprn2P80560 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptprn2P80560 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptprn2P80560 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptprn2P80560 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ptprn2P80560 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ptprn2P80560 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ptprn2P80560 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptprn2P80560 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptprn2P80560 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ptprn2P80560 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptprn2P80560 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptprn2P80560 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ptprn2P80560 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ptprn2P80560 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ptprn2P80560 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ptprn2P80560 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ptprn2P80560 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptprn2P80560 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptprn2P80560 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptprn2P80560 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptprn2P80560 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ptprn2P80560 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ptprn2P80560 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptprn2P80560 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ptprn2P80560 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptprn2P80560 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptprn2P80560 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ptprn2P80560 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ptprn2P80560 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptprn2P80560 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptprn2P80560 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptprn2P80560 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptprn2P80560 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ptprn2P80560 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptprn2P80560 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ptprn2P80560 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptprn2P80560 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ptprn2P80560 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ptprn2P80560 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ptprn2P80560 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ptprn2P80560 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ptprn2P80560 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptprn2P80560 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptprn2P80560 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptprn2P80560 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptprn2P80560 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptprn2P80560 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptprn2P80560 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptprn2P80560 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptprn2P80560 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ptprn2P80560 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptprn2P80560 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptprn2P80560 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ptprn2P80560 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptprn2P80560 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptprn2P80560 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptprn2P80560 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptprn2P80560 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptprn2P80560 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ptprn2P80560 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptprn2P80560 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ptprn2P80560 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptprn2P80560 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptprn2P80560 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptprn2P80560 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptprn2P80560 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ptprn2P80560 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ptprn2P80560 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ptprn2P80560 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ptprn2P80560 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ptprn2P80560 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ptprn2P80560 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptprn2P80560 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ptprn2P80560 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ptprn2P80560 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptprn2P80560 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptprn2P80560 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptprn2P80560 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptprn2P80560 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ptprn2P80560 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptprn2P80560 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptprn2P80560 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ptprn2P80560 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptprn2P80560 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptprn2P80560 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ptprn2P80560 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptprn2P80560 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptprn2P80560 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms