Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Otx2P80206 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Otx2P80206 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Otx2P80206 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Otx2P80206 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Otx2P80206 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
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Otx2P80206 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Otx2P80206 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
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