Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smad1P70340 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smad1P70340 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smad1P70340 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smad1P70340 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Smad1P70340 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smad1P70340 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smad1P70340 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smad1P70340 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smad1P70340 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smad1P70340 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Smad1P70340 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smad1P70340 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Smad1P70340 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smad1P70340 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Smad1P70340 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smad1P70340 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smad1P70340 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smad1P70340 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smad1P70340 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smad1P70340 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smad1P70340 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smad1P70340 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smad1P70340 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smad1P70340 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smad1P70340 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smad1P70340 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smad1P70340 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smad1P70340 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smad1P70340 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smad1P70340 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smad1P70340 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smad1P70340 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smad1P70340 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smad1P70340 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smad1P70340 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smad1P70340 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smad1P70340 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smad1P70340 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smad1P70340 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smad1P70340 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smad1P70340 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smad1P70340 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smad1P70340 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smad1P70340 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smad1P70340 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smad1P70340 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smad1P70340 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Smad1P70340 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smad1P70340 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smad1P70340 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Smad1P70340 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Smad1P70340 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Smad1P70340 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Smad1P70340 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Smad1P70340 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smad1P70340 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Smad1P70340 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smad1P70340 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smad1P70340 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smad1P70340 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smad1P70340 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smad1P70340 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Smad1P70340 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Smad1P70340 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Smad1P70340 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smad1P70340 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smad1P70340 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smad1P70340 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smad1P70340 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smad1P70340 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smad1P70340 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Smad1P70340 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Smad1P70340 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smad1P70340 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smad1P70340 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smad1P70340 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Smad1P70340 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smad1P70340 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smad1P70340 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Smad1P70340 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smad1P70340 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smad1P70340 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smad1P70340 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smad1P70340 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smad1P70340 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smad1P70340 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Smad1P70340 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smad1P70340 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Smad1P70340 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Smad1P70340 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Smad1P70340 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Smad1P70340 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smad1P70340 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smad1P70340 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Smad1P70340 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smad1P70340 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smad1P70340 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smad1P70340 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smad1P70340 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms