Protein–RNA interactions for Protein: P70268

Pkn1, Serine/threonine-protein kinase N1, mousemouse

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Length 946 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn1P70268 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkn1P70268 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pkn1P70268 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkn1P70268 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkn1P70268 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkn1P70268 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkn1P70268 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkn1P70268 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkn1P70268 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkn1P70268 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkn1P70268 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkn1P70268 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkn1P70268 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkn1P70268 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkn1P70268 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkn1P70268 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkn1P70268 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkn1P70268 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkn1P70268 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkn1P70268 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkn1P70268 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkn1P70268 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkn1P70268 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkn1P70268 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkn1P70268 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkn1P70268 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkn1P70268 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkn1P70268 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkn1P70268 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkn1P70268 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkn1P70268 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkn1P70268 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkn1P70268 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkn1P70268 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkn1P70268 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkn1P70268 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkn1P70268 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkn1P70268 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkn1P70268 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkn1P70268 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkn1P70268 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkn1P70268 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkn1P70268 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Pkn1P70268 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkn1P70268 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkn1P70268 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkn1P70268 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Pkn1P70268 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Pkn1P70268 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkn1P70268 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkn1P70268 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkn1P70268 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkn1P70268 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkn1P70268 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkn1P70268 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
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Pkn1P70268 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkn1P70268 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Pkn1P70268 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkn1P70268 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkn1P70268 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkn1P70268 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkn1P70268 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkn1P70268 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkn1P70268 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkn1P70268 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkn1P70268 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkn1P70268 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkn1P70268 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkn1P70268 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkn1P70268 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkn1P70268 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkn1P70268 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkn1P70268 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkn1P70268 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkn1P70268 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkn1P70268 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkn1P70268 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkn1P70268 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkn1P70268 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkn1P70268 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.4 ms