Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrpd1P62315 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrpd1P62315 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrpd1P62315 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrpd1P62315 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrpd1P62315 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrpd1P62315 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrpd1P62315 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrpd1P62315 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrpd1P62315 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrpd1P62315 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrpd1P62315 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrpd1P62315 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrpd1P62315 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrpd1P62315 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrpd1P62315 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Snrpd1P62315 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrpd1P62315 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Snrpd1P62315 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Snrpd1P62315 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Snrpd1P62315 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Snrpd1P62315 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Snrpd1P62315 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Snrpd1P62315 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Snrpd1P62315 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Snrpd1P62315 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Snrpd1P62315 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Snrpd1P62315 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms