Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga11P61622 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Itga11P61622 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga11P61622 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Itga11P61622 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga11P61622 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga11P61622 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga11P61622 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga11P61622 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga11P61622 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itga11P61622 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Itga11P61622 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Itga11P61622 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Itga11P61622 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itga11P61622 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itga11P61622 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itga11P61622 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Itga11P61622 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itga11P61622 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Itga11P61622 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itga11P61622 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itga11P61622 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Itga11P61622 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itga11P61622 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Itga11P61622 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Itga11P61622 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itga11P61622 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Itga11P61622 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Itga11P61622 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itga11P61622 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Itga11P61622 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Itga11P61622 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Itga11P61622 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itga11P61622 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Itga11P61622 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itga11P61622 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itga11P61622 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Itga11P61622 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Itga11P61622 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itga11P61622 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itga11P61622 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itga11P61622 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Itga11P61622 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itga11P61622 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Itga11P61622 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itga11P61622 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Itga11P61622 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Itga11P61622 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Itga11P61622 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Itga11P61622 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Itga11P61622 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Itga11P61622 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Itga11P61622 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Itga11P61622 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itga11P61622 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itga11P61622 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itga11P61622 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Itga11P61622 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itga11P61622 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itga11P61622 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itga11P61622 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Itga11P61622 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Itga11P61622 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Itga11P61622 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Itga11P61622 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Itga11P61622 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Itga11P61622 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Itga11P61622 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Itga11P61622 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Itga11P61622 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Itga11P61622 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Itga11P61622 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Itga11P61622 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Itga11P61622 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Itga11P61622 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Itga11P61622 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Itga11P61622 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Itga11P61622 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Itga11P61622 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Itga11P61622 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Itga11P61622 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Itga11P61622 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Itga11P61622 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Itga11P61622 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Itga11P61622 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Itga11P61622 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itga11P61622 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Itga11P61622 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itga11P61622 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Itga11P61622 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itga11P61622 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itga11P61622 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Itga11P61622 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itga11P61622 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itga11P61622 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Itga11P61622 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga11P61622 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga11P61622 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga11P61622 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itga11P61622 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms