Protein–RNA interactions for Protein: P61216

Taf13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf13P61216 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf13P61216 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf13P61216 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf13P61216 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf13P61216 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Taf13P61216 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Taf13P61216 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Taf13P61216 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Taf13P61216 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Taf13P61216 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Taf13P61216 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Taf13P61216 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Taf13P61216 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Taf13P61216 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Taf13P61216 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Taf13P61216 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Taf13P61216 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Taf13P61216 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Taf13P61216 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Taf13P61216 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Taf13P61216 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Taf13P61216 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Taf13P61216 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Taf13P61216 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Taf13P61216 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Taf13P61216 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Taf13P61216 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Taf13P61216 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Taf13P61216 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Taf13P61216 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Taf13P61216 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Taf13P61216 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Taf13P61216 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Taf13P61216 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Taf13P61216 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Taf13P61216 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Taf13P61216 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Taf13P61216 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Taf13P61216 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Taf13P61216 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.8 ms