Protein–RNA interactions for Protein: P61014

Pln, Cardiac phospholamban, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PlnP61014 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PlnP61014 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PlnP61014 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PlnP61014 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PlnP61014 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PlnP61014 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PlnP61014 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PlnP61014 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PlnP61014 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PlnP61014 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PlnP61014 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
PlnP61014 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
PlnP61014 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PlnP61014 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PlnP61014 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PlnP61014 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PlnP61014 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PlnP61014 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PlnP61014 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PlnP61014 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PlnP61014 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PlnP61014 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PlnP61014 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PlnP61014 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PlnP61014 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PlnP61014 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PlnP61014 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PlnP61014 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PlnP61014 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PlnP61014 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PlnP61014 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PlnP61014 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PlnP61014 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PlnP61014 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PlnP61014 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PlnP61014 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PlnP61014 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PlnP61014 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PlnP61014 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PlnP61014 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PlnP61014 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PlnP61014 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PlnP61014 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PlnP61014 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
PlnP61014 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PlnP61014 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
PlnP61014 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PlnP61014 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PlnP61014 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PlnP61014 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PlnP61014 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PlnP61014 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PlnP61014 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PlnP61014 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PlnP61014 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PlnP61014 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PlnP61014 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PlnP61014 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PlnP61014 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PlnP61014 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PlnP61014 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PlnP61014 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PlnP61014 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PlnP61014 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PlnP61014 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PlnP61014 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PlnP61014 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PlnP61014 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PlnP61014 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PlnP61014 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PlnP61014 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PlnP61014 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PlnP61014 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PlnP61014 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
PlnP61014 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.52□□□□□ -0.72
PlnP61014 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
PlnP61014 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
PlnP61014 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
PlnP61014 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
PlnP61014 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
PlnP61014 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
PlnP61014 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
PlnP61014 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
PlnP61014 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
PlnP61014 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
PlnP61014 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
PlnP61014 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PlnP61014 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PlnP61014 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PlnP61014 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PlnP61014 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PlnP61014 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PlnP61014 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PlnP61014 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PlnP61014 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PlnP61014 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PlnP61014 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PlnP61014 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PlnP61014 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PlnP61014 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms