Protein–RNA interactions for Protein: P60898

Polr2i, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2iP60898 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Polr2iP60898 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms