Protein–RNA interactions for Protein: P60710

Actb, Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ActbP60710 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ActbP60710 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ActbP60710 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ActbP60710 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ActbP60710 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ActbP60710 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ActbP60710 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ActbP60710 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ActbP60710 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ActbP60710 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ActbP60710 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
ActbP60710 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
ActbP60710 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
ActbP60710 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
ActbP60710 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ActbP60710 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ActbP60710 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
ActbP60710 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ActbP60710 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ActbP60710 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ActbP60710 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ActbP60710 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
ActbP60710 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ActbP60710 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ActbP60710 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ActbP60710 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ActbP60710 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ActbP60710 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ActbP60710 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ActbP60710 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ActbP60710 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ActbP60710 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ActbP60710 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ActbP60710 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ActbP60710 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ActbP60710 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ActbP60710 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ActbP60710 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ActbP60710 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ActbP60710 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ActbP60710 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ActbP60710 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ActbP60710 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ActbP60710 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ActbP60710 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ActbP60710 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ActbP60710 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ActbP60710 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ActbP60710 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ActbP60710 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
ActbP60710 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ActbP60710 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ActbP60710 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ActbP60710 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
ActbP60710 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ActbP60710 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ActbP60710 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ActbP60710 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ActbP60710 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ActbP60710 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ActbP60710 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ActbP60710 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ActbP60710 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ActbP60710 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ActbP60710 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ActbP60710 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ActbP60710 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ActbP60710 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ActbP60710 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ActbP60710 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ActbP60710 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ActbP60710 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ActbP60710 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ActbP60710 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ActbP60710 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ActbP60710 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ActbP60710 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ActbP60710 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ActbP60710 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ActbP60710 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ActbP60710 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ActbP60710 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ActbP60710 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ActbP60710 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ActbP60710 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
ActbP60710 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ActbP60710 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ActbP60710 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ActbP60710 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ActbP60710 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
ActbP60710 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ActbP60710 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ActbP60710 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ActbP60710 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
ActbP60710 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ActbP60710 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ActbP60710 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ActbP60710 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ActbP60710 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ActbP60710 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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