Protein–RNA interactions for Protein: P59222

Scarf2, Scavenger receptor class F member 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf2P59222 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scarf2P59222 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scarf2P59222 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms