Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Samsn1P57725 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms