Protein–RNA interactions for Protein: P56450

Mc4r, Melanocortin receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc4rP56450 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Mc4rP56450 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mc4rP56450 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mc4rP56450 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mc4rP56450 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mc4rP56450 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mc4rP56450 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Mc4rP56450 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mc4rP56450 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Mc4rP56450 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mc4rP56450 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mc4rP56450 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mc4rP56450 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mc4rP56450 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mc4rP56450 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mc4rP56450 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mc4rP56450 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mc4rP56450 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mc4rP56450 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mc4rP56450 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mc4rP56450 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mc4rP56450 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mc4rP56450 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mc4rP56450 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mc4rP56450 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mc4rP56450 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Mc4rP56450 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mc4rP56450 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mc4rP56450 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mc4rP56450 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mc4rP56450 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mc4rP56450 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Mc4rP56450 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mc4rP56450 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Mc4rP56450 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Mc4rP56450 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mc4rP56450 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mc4rP56450 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mc4rP56450 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mc4rP56450 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mc4rP56450 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mc4rP56450 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mc4rP56450 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mc4rP56450 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mc4rP56450 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mc4rP56450 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mc4rP56450 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mc4rP56450 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mc4rP56450 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mc4rP56450 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mc4rP56450 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mc4rP56450 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mc4rP56450 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mc4rP56450 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mc4rP56450 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mc4rP56450 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mc4rP56450 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mc4rP56450 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Mc4rP56450 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mc4rP56450 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mc4rP56450 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Mc4rP56450 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mc4rP56450 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mc4rP56450 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mc4rP56450 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mc4rP56450 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mc4rP56450 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mc4rP56450 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mc4rP56450 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mc4rP56450 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mc4rP56450 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mc4rP56450 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mc4rP56450 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mc4rP56450 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mc4rP56450 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mc4rP56450 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mc4rP56450 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mc4rP56450 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mc4rP56450 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mc4rP56450 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mc4rP56450 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mc4rP56450 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mc4rP56450 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Mc4rP56450 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mc4rP56450 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Mc4rP56450 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mc4rP56450 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mc4rP56450 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mc4rP56450 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Mc4rP56450 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Mc4rP56450 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mc4rP56450 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mc4rP56450 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Mc4rP56450 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Mc4rP56450 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mc4rP56450 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Mc4rP56450 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mc4rP56450 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mc4rP56450 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Mc4rP56450 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms