Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gp1bbP56400 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gp1bbP56400 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms