Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp5P56399 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp5P56399 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp5P56399 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp5P56399 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp5P56399 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp5P56399 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp5P56399 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms