Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cux1P53564 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cux1P53564 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cux1P53564 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cux1P53564 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cux1P53564 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cux1P53564 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cux1P53564 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cux1P53564 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cux1P53564 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cux1P53564 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cux1P53564 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cux1P53564 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cux1P53564 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cux1P53564 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cux1P53564 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cux1P53564 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cux1P53564 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cux1P53564 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cux1P53564 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cux1P53564 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cux1P53564 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cux1P53564 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cux1P53564 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cux1P53564 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cux1P53564 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cux1P53564 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cux1P53564 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cux1P53564 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cux1P53564 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cux1P53564 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cux1P53564 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cux1P53564 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cux1P53564 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cux1P53564 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cux1P53564 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cux1P53564 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cux1P53564 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cux1P53564 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cux1P53564 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cux1P53564 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cux1P53564 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cux1P53564 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cux1P53564 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cux1P53564 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cux1P53564 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cux1P53564 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cux1P53564 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cux1P53564 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cux1P53564 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cux1P53564 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cux1P53564 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cux1P53564 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cux1P53564 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cux1P53564 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cux1P53564 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cux1P53564 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cux1P53564 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cux1P53564 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cux1P53564 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cux1P53564 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cux1P53564 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cux1P53564 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cux1P53564 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cux1P53564 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cux1P53564 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cux1P53564 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cux1P53564 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cux1P53564 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cux1P53564 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cux1P53564 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cux1P53564 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cux1P53564 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cux1P53564 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cux1P53564 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cux1P53564 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cux1P53564 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Cux1P53564 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cux1P53564 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cux1P53564 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cux1P53564 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cux1P53564 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cux1P53564 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Cux1P53564 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cux1P53564 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cux1P53564 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cux1P53564 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cux1P53564 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cux1P53564 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cux1P53564 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cux1P53564 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms