Protein–RNA interactions for Protein: P53349

Map3k1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k1P53349 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Map3k1P53349 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Map3k1P53349 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Map3k1P53349 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Map3k1P53349 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Map3k1P53349 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Map3k1P53349 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Map3k1P53349 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Map3k1P53349 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Map3k1P53349 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Map3k1P53349 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Map3k1P53349 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Map3k1P53349 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Map3k1P53349 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Map3k1P53349 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Map3k1P53349 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Map3k1P53349 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Map3k1P53349 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Map3k1P53349 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Map3k1P53349 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Map3k1P53349 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Map3k1P53349 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Map3k1P53349 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Map3k1P53349 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Map3k1P53349 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Map3k1P53349 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Map3k1P53349 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Map3k1P53349 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Map3k1P53349 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Map3k1P53349 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Map3k1P53349 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Map3k1P53349 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Map3k1P53349 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Map3k1P53349 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Map3k1P53349 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Map3k1P53349 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Map3k1P53349 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Map3k1P53349 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Map3k1P53349 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Map3k1P53349 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Map3k1P53349 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Map3k1P53349 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Map3k1P53349 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Map3k1P53349 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Map3k1P53349 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Map3k1P53349 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Map3k1P53349 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Map3k1P53349 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Map3k1P53349 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Map3k1P53349 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Map3k1P53349 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Map3k1P53349 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Map3k1P53349 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Map3k1P53349 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Map3k1P53349 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Map3k1P53349 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Map3k1P53349 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Map3k1P53349 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Map3k1P53349 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Map3k1P53349 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Map3k1P53349 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Map3k1P53349 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Map3k1P53349 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Map3k1P53349 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Map3k1P53349 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Map3k1P53349 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Map3k1P53349 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Map3k1P53349 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Map3k1P53349 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Map3k1P53349 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Map3k1P53349 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Map3k1P53349 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Map3k1P53349 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Map3k1P53349 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Map3k1P53349 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Map3k1P53349 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Map3k1P53349 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Map3k1P53349 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Map3k1P53349 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Map3k1P53349 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Map3k1P53349 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Map3k1P53349 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Map3k1P53349 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Map3k1P53349 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Map3k1P53349 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Map3k1P53349 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Map3k1P53349 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Map3k1P53349 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Map3k1P53349 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Map3k1P53349 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Map3k1P53349 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Map3k1P53349 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Map3k1P53349 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Map3k1P53349 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Map3k1P53349 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Map3k1P53349 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Map3k1P53349 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Map3k1P53349 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Map3k1P53349 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Map3k1P53349 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms