Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ube2e3P52483 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ube2e3P52483 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ube2e3P52483 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ube2e3P52483 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ube2e3P52483 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ube2e3P52483 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ube2e3P52483 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ube2e3P52483 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ube2e3P52483 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ube2e3P52483 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ube2e3P52483 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ube2e3P52483 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ube2e3P52483 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ube2e3P52483 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ube2e3P52483 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ube2e3P52483 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ube2e3P52483 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ube2e3P52483 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ube2e3P52483 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ube2e3P52483 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ube2e3P52483 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ube2e3P52483 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ube2e3P52483 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ube2e3P52483 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ube2e3P52483 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ube2e3P52483 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ube2e3P52483 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ube2e3P52483 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ube2e3P52483 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ube2e3P52483 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ube2e3P52483 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ube2e3P52483 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ube2e3P52483 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ube2e3P52483 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ube2e3P52483 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ube2e3P52483 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ube2e3P52483 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ube2e3P52483 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ube2e3P52483 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ube2e3P52483 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ube2e3P52483 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ube2e3P52483 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ube2e3P52483 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ube2e3P52483 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ube2e3P52483 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ube2e3P52483 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ube2e3P52483 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ube2e3P52483 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ube2e3P52483 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ube2e3P52483 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ube2e3P52483 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ube2e3P52483 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ube2e3P52483 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ube2e3P52483 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ube2e3P52483 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ube2e3P52483 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Ube2e3P52483 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ube2e3P52483 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ube2e3P52483 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ube2e3P52483 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ube2e3P52483 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ube2e3P52483 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ube2e3P52483 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ube2e3P52483 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ube2e3P52483 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ube2e3P52483 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ube2e3P52483 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ube2e3P52483 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ube2e3P52483 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ube2e3P52483 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ube2e3P52483 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ube2e3P52483 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ube2e3P52483 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ube2e3P52483 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ube2e3P52483 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ube2e3P52483 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ube2e3P52483 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ube2e3P52483 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ube2e3P52483 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ube2e3P52483 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ube2e3P52483 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ube2e3P52483 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ube2e3P52483 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ube2e3P52483 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ube2e3P52483 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ube2e3P52483 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ube2e3P52483 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ube2e3P52483 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ube2e3P52483 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ube2e3P52483 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ube2e3P52483 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ube2e3P52483 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ube2e3P52483 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ube2e3P52483 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ube2e3P52483 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ube2e3P52483 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ube2e3P52483 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ube2e3P52483 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ube2e3P52483 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms