Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Apobec1P51908 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms