Protein–RNA interactions for Protein: P51450

Rorc, Nuclear receptor ROR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RorcP51450 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RorcP51450 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RorcP51450 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RorcP51450 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RorcP51450 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RorcP51450 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RorcP51450 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RorcP51450 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RorcP51450 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RorcP51450 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RorcP51450 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RorcP51450 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RorcP51450 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RorcP51450 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RorcP51450 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RorcP51450 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RorcP51450 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RorcP51450 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RorcP51450 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RorcP51450 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RorcP51450 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RorcP51450 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RorcP51450 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RorcP51450 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RorcP51450 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RorcP51450 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RorcP51450 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RorcP51450 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RorcP51450 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RorcP51450 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RorcP51450 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RorcP51450 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RorcP51450 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RorcP51450 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RorcP51450 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RorcP51450 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RorcP51450 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RorcP51450 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RorcP51450 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RorcP51450 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RorcP51450 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RorcP51450 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RorcP51450 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RorcP51450 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RorcP51450 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RorcP51450 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RorcP51450 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RorcP51450 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RorcP51450 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RorcP51450 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RorcP51450 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RorcP51450 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RorcP51450 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RorcP51450 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RorcP51450 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RorcP51450 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RorcP51450 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RorcP51450 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RorcP51450 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RorcP51450 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RorcP51450 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RorcP51450 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RorcP51450 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RorcP51450 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RorcP51450 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RorcP51450 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RorcP51450 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RorcP51450 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RorcP51450 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RorcP51450 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RorcP51450 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RorcP51450 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RorcP51450 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RorcP51450 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RorcP51450 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RorcP51450 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RorcP51450 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RorcP51450 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RorcP51450 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RorcP51450 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RorcP51450 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RorcP51450 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RorcP51450 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RorcP51450 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RorcP51450 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RorcP51450 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RorcP51450 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RorcP51450 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RorcP51450 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RorcP51450 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RorcP51450 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RorcP51450 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RorcP51450 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RorcP51450 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RorcP51450 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RorcP51450 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RorcP51450 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RorcP51450 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RorcP51450 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RorcP51450 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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