Protein–RNA interactions for Protein: P50446

Krt6a, Keratin, type II cytoskeletal 6A, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt6aP50446 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Krt6aP50446 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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