Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tmod1P49813 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmod1P49813 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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