Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Psen1P49769 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Il2-201ENSMUST00000029275 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psen1P49769 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Psen1P49769 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psen1P49769 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Gm9723-201ENSMUST00000192100 457 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psen1P49769 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Gm38188-201ENSMUST00000192879 856 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Psen1P49769 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Olfr1437-201ENSMUST00000052558 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psen1P49769 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psen1P49769 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psen1P49769 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psen1P49769 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psen1P49769 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psen1P49769 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Gm45359-201ENSMUST00000210635 427 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Psen1P49769 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psen1P49769 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms