Protein–RNA interactions for Protein: P49766

Vegfb, Vascular endothelial growth factor B, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfbP49766 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VegfbP49766 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VegfbP49766 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VegfbP49766 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VegfbP49766 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VegfbP49766 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VegfbP49766 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VegfbP49766 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VegfbP49766 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VegfbP49766 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VegfbP49766 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VegfbP49766 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VegfbP49766 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VegfbP49766 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VegfbP49766 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VegfbP49766 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VegfbP49766 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VegfbP49766 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
VegfbP49766 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
VegfbP49766 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VegfbP49766 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VegfbP49766 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VegfbP49766 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VegfbP49766 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VegfbP49766 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
VegfbP49766 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VegfbP49766 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VegfbP49766 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VegfbP49766 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VegfbP49766 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
VegfbP49766 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VegfbP49766 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
VegfbP49766 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VegfbP49766 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VegfbP49766 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VegfbP49766 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VegfbP49766 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VegfbP49766 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VegfbP49766 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VegfbP49766 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VegfbP49766 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
VegfbP49766 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VegfbP49766 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VegfbP49766 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
VegfbP49766 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VegfbP49766 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
VegfbP49766 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
VegfbP49766 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VegfbP49766 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VegfbP49766 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VegfbP49766 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VegfbP49766 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VegfbP49766 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VegfbP49766 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VegfbP49766 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VegfbP49766 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VegfbP49766 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VegfbP49766 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VegfbP49766 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VegfbP49766 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VegfbP49766 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VegfbP49766 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
VegfbP49766 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VegfbP49766 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VegfbP49766 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VegfbP49766 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
VegfbP49766 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VegfbP49766 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VegfbP49766 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VegfbP49766 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VegfbP49766 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VegfbP49766 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VegfbP49766 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
VegfbP49766 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VegfbP49766 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VegfbP49766 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VegfbP49766 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VegfbP49766 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VegfbP49766 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VegfbP49766 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VegfbP49766 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VegfbP49766 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VegfbP49766 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VegfbP49766 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VegfbP49766 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VegfbP49766 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VegfbP49766 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VegfbP49766 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VegfbP49766 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VegfbP49766 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VegfbP49766 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VegfbP49766 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VegfbP49766 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VegfbP49766 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VegfbP49766 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VegfbP49766 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VegfbP49766 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VegfbP49766 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VegfbP49766 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
VegfbP49766 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms