Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnni3P48787 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tnni3P48787 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms