Protein–RNA interactions for Protein: P48754

Brca1, Breast cancer type 1 susceptibility protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca1P48754 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brca1P48754 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brca1P48754 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Brca1P48754 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brca1P48754 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brca1P48754 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brca1P48754 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brca1P48754 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brca1P48754 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brca1P48754 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brca1P48754 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brca1P48754 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Brca1P48754 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brca1P48754 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brca1P48754 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brca1P48754 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brca1P48754 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brca1P48754 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brca1P48754 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brca1P48754 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brca1P48754 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Brca1P48754 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Brca1P48754 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brca1P48754 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brca1P48754 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brca1P48754 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brca1P48754 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brca1P48754 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brca1P48754 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brca1P48754 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brca1P48754 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brca1P48754 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brca1P48754 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brca1P48754 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brca1P48754 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brca1P48754 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Brca1P48754 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Brca1P48754 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Brca1P48754 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Brca1P48754 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Brca1P48754 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Brca1P48754 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Brca1P48754 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Brca1P48754 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Brca1P48754 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Brca1P48754 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Brca1P48754 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Brca1P48754 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Brca1P48754 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Brca1P48754 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Brca1P48754 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Brca1P48754 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Brca1P48754 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brca1P48754 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brca1P48754 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brca1P48754 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brca1P48754 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brca1P48754 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.5 ms