Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LmnaP48678 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LmnaP48678 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LmnaP48678 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.02
LmnaP48678 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LmnaP48678 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LmnaP48678 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LmnaP48678 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LmnaP48678 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LmnaP48678 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LmnaP48678 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LmnaP48678 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LmnaP48678 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LmnaP48678 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LmnaP48678 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LmnaP48678 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LmnaP48678 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LmnaP48678 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LmnaP48678 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LmnaP48678 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LmnaP48678 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LmnaP48678 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LmnaP48678 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LmnaP48678 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LmnaP48678 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LmnaP48678 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LmnaP48678 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LmnaP48678 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LmnaP48678 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LmnaP48678 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LmnaP48678 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LmnaP48678 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LmnaP48678 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LmnaP48678 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LmnaP48678 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LmnaP48678 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LmnaP48678 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LmnaP48678 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LmnaP48678 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LmnaP48678 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LmnaP48678 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LmnaP48678 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LmnaP48678 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LmnaP48678 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LmnaP48678 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LmnaP48678 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LmnaP48678 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LmnaP48678 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LmnaP48678 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LmnaP48678 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LmnaP48678 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LmnaP48678 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LmnaP48678 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LmnaP48678 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LmnaP48678 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LmnaP48678 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LmnaP48678 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LmnaP48678 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LmnaP48678 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LmnaP48678 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LmnaP48678 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LmnaP48678 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms