Protein–RNA interactions for Protein: P47939

Resp18, Regulated endocrine-specific protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Resp18P47939 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Resp18P47939 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Resp18P47939 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Resp18P47939 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Resp18P47939 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Resp18P47939 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Resp18P47939 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Resp18P47939 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Resp18P47939 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Resp18P47939 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Resp18P47939 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Resp18P47939 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Resp18P47939 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Resp18P47939 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Resp18P47939 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Resp18P47939 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms