Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SrprbP47758 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SrprbP47758 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SrprbP47758 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SrprbP47758 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SrprbP47758 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrprbP47758 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SrprbP47758 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SrprbP47758 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SrprbP47758 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms