Protein–RNA interactions for Protein: P43027

Gdf5, Growth/differentiation factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf5P43027 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gdf5P43027 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gdf5P43027 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gdf5P43027 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gdf5P43027 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gdf5P43027 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gdf5P43027 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gdf5P43027 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gdf5P43027 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gdf5P43027 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gdf5P43027 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gdf5P43027 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gdf5P43027 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gdf5P43027 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gdf5P43027 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gdf5P43027 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gdf5P43027 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gdf5P43027 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gdf5P43027 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gdf5P43027 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gdf5P43027 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gdf5P43027 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gdf5P43027 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gdf5P43027 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gdf5P43027 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gdf5P43027 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gdf5P43027 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gdf5P43027 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gdf5P43027 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gdf5P43027 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gdf5P43027 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gdf5P43027 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gdf5P43027 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gdf5P43027 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gdf5P43027 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gdf5P43027 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gdf5P43027 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gdf5P43027 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gdf5P43027 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gdf5P43027 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gdf5P43027 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gdf5P43027 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gdf5P43027 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gdf5P43027 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gdf5P43027 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gdf5P43027 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gdf5P43027 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gdf5P43027 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gdf5P43027 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gdf5P43027 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gdf5P43027 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gdf5P43027 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gdf5P43027 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gdf5P43027 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gdf5P43027 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gdf5P43027 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gdf5P43027 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gdf5P43027 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gdf5P43027 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gdf5P43027 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gdf5P43027 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gdf5P43027 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gdf5P43027 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gdf5P43027 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gdf5P43027 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gdf5P43027 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gdf5P43027 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gdf5P43027 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gdf5P43027 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gdf5P43027 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gdf5P43027 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gdf5P43027 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gdf5P43027 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gdf5P43027 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gdf5P43027 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gdf5P43027 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gdf5P43027 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gdf5P43027 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gdf5P43027 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gdf5P43027 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gdf5P43027 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gdf5P43027 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gdf5P43027 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gdf5P43027 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gdf5P43027 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gdf5P43027 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gdf5P43027 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gdf5P43027 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gdf5P43027 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gdf5P43027 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gdf5P43027 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gdf5P43027 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gdf5P43027 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gdf5P43027 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gdf5P43027 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gdf5P43027 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gdf5P43027 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gdf5P43027 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gdf5P43027 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gdf5P43027 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms