Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rpl28P41105 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
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