Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
VhlP40338 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
VhlP40338 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
VhlP40338 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
VhlP40338 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
VhlP40338 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
VhlP40338 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
VhlP40338 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
VhlP40338 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
VhlP40338 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
VhlP40338 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
VhlP40338 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
VhlP40338 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
VhlP40338 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
VhlP40338 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
VhlP40338 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
VhlP40338 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
VhlP40338 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
VhlP40338 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
VhlP40338 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
VhlP40338 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
VhlP40338 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
VhlP40338 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
VhlP40338 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
VhlP40338 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
VhlP40338 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
VhlP40338 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
VhlP40338 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
VhlP40338 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
VhlP40338 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
VhlP40338 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
VhlP40338 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
VhlP40338 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
VhlP40338 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
VhlP40338 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
VhlP40338 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
VhlP40338 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
VhlP40338 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
VhlP40338 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
VhlP40338 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
VhlP40338 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
VhlP40338 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
VhlP40338 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
VhlP40338 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
VhlP40338 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
VhlP40338 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
VhlP40338 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
VhlP40338 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
VhlP40338 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
VhlP40338 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
VhlP40338 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
VhlP40338 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
VhlP40338 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
VhlP40338 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
VhlP40338 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
VhlP40338 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
VhlP40338 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
VhlP40338 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
VhlP40338 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
VhlP40338 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
VhlP40338 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
VhlP40338 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
VhlP40338 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
VhlP40338 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
VhlP40338 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
VhlP40338 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
VhlP40338 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
VhlP40338 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
VhlP40338 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
VhlP40338 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
VhlP40338 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
VhlP40338 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
VhlP40338 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
VhlP40338 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
VhlP40338 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
VhlP40338 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
VhlP40338 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
VhlP40338 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
VhlP40338 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
VhlP40338 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
VhlP40338 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
VhlP40338 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
VhlP40338 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
VhlP40338 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
VhlP40338 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
VhlP40338 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
VhlP40338 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
VhlP40338 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
VhlP40338 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
VhlP40338 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
VhlP40338 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
VhlP40338 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
VhlP40338 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
VhlP40338 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
VhlP40338 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
VhlP40338 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
VhlP40338 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
VhlP40338 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
VhlP40338 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
VhlP40338 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
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