Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chd1P40201 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chd1P40201 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Chd1P40201 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chd1P40201 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chd1P40201 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chd1P40201 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chd1P40201 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chd1P40201 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chd1P40201 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chd1P40201 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chd1P40201 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chd1P40201 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chd1P40201 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chd1P40201 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Chd1P40201 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Chd1P40201 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chd1P40201 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chd1P40201 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chd1P40201 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chd1P40201 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chd1P40201 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chd1P40201 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Chd1P40201 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Chd1P40201 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chd1P40201 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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