Protein–RNA interactions for Protein: P39428

Traf1, TNF receptor-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf1P39428 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Traf1P39428 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Traf1P39428 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Traf1P39428 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Traf1P39428 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Traf1P39428 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Traf1P39428 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Traf1P39428 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Traf1P39428 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Traf1P39428 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Traf1P39428 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Traf1P39428 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Traf1P39428 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Traf1P39428 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Traf1P39428 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Traf1P39428 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Traf1P39428 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Traf1P39428 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Traf1P39428 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Traf1P39428 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Traf1P39428 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Traf1P39428 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Traf1P39428 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Traf1P39428 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Traf1P39428 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Traf1P39428 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Traf1P39428 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Traf1P39428 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Traf1P39428 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Traf1P39428 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Traf1P39428 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Traf1P39428 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Traf1P39428 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Traf1P39428 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Traf1P39428 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Traf1P39428 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Traf1P39428 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Traf1P39428 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Traf1P39428 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Traf1P39428 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms