Protein–RNA interactions for Protein: P35396

Ppard, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpardP35396 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PpardP35396 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PpardP35396 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PpardP35396 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PpardP35396 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PpardP35396 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PpardP35396 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PpardP35396 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PpardP35396 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PpardP35396 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PpardP35396 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PpardP35396 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PpardP35396 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PpardP35396 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PpardP35396 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PpardP35396 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PpardP35396 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PpardP35396 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PpardP35396 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PpardP35396 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PpardP35396 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PpardP35396 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PpardP35396 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PpardP35396 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PpardP35396 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PpardP35396 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PpardP35396 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PpardP35396 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PpardP35396 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PpardP35396 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PpardP35396 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PpardP35396 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PpardP35396 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PpardP35396 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PpardP35396 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PpardP35396 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PpardP35396 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PpardP35396 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PpardP35396 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PpardP35396 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PpardP35396 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PpardP35396 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PpardP35396 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PpardP35396 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PpardP35396 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PpardP35396 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PpardP35396 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PpardP35396 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PpardP35396 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PpardP35396 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PpardP35396 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PpardP35396 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PpardP35396 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PpardP35396 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PpardP35396 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PpardP35396 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PpardP35396 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PpardP35396 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PpardP35396 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PpardP35396 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PpardP35396 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PpardP35396 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PpardP35396 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PpardP35396 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PpardP35396 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PpardP35396 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PpardP35396 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PpardP35396 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PpardP35396 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PpardP35396 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PpardP35396 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PpardP35396 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PpardP35396 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PpardP35396 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PpardP35396 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PpardP35396 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PpardP35396 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PpardP35396 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PpardP35396 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PpardP35396 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PpardP35396 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PpardP35396 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PpardP35396 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PpardP35396 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PpardP35396 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PpardP35396 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PpardP35396 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PpardP35396 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PpardP35396 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PpardP35396 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PpardP35396 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PpardP35396 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PpardP35396 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PpardP35396 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PpardP35396 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PpardP35396 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PpardP35396 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PpardP35396 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PpardP35396 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PpardP35396 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms