Protein–RNA interactions for Protein: P35235

Ptpn11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn11P35235 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn11P35235 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms