Protein–RNA interactions for Protein: P33435

Mmp13, Collagenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp13P33435 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mmp13P33435 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mmp13P33435 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mmp13P33435 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mmp13P33435 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mmp13P33435 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mmp13P33435 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mmp13P33435 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mmp13P33435 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mmp13P33435 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mmp13P33435 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mmp13P33435 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mmp13P33435 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mmp13P33435 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mmp13P33435 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mmp13P33435 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mmp13P33435 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mmp13P33435 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mmp13P33435 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mmp13P33435 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mmp13P33435 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mmp13P33435 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mmp13P33435 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mmp13P33435 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mmp13P33435 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mmp13P33435 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mmp13P33435 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mmp13P33435 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mmp13P33435 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mmp13P33435 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mmp13P33435 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mmp13P33435 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mmp13P33435 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Mmp13P33435 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mmp13P33435 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mmp13P33435 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mmp13P33435 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mmp13P33435 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mmp13P33435 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mmp13P33435 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mmp13P33435 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mmp13P33435 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mmp13P33435 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mmp13P33435 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Mmp13P33435 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mmp13P33435 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mmp13P33435 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mmp13P33435 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mmp13P33435 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mmp13P33435 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mmp13P33435 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mmp13P33435 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mmp13P33435 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mmp13P33435 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mmp13P33435 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Mmp13P33435 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mmp13P33435 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mmp13P33435 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mmp13P33435 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mmp13P33435 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mmp13P33435 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mmp13P33435 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mmp13P33435 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mmp13P33435 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mmp13P33435 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mmp13P33435 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mmp13P33435 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mmp13P33435 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mmp13P33435 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mmp13P33435 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mmp13P33435 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mmp13P33435 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mmp13P33435 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mmp13P33435 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mmp13P33435 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mmp13P33435 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mmp13P33435 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mmp13P33435 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mmp13P33435 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mmp13P33435 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mmp13P33435 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mmp13P33435 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mmp13P33435 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mmp13P33435 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mmp13P33435 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mmp13P33435 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mmp13P33435 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mmp13P33435 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mmp13P33435 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mmp13P33435 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mmp13P33435 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mmp13P33435 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mmp13P33435 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mmp13P33435 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mmp13P33435 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mmp13P33435 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mmp13P33435 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mmp13P33435 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mmp13P33435 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Mmp13P33435 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms