Protein–RNA interactions for Protein: P31001

Des, Desmin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DesP31001 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DesP31001 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DesP31001 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DesP31001 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DesP31001 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DesP31001 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
DesP31001 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DesP31001 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DesP31001 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DesP31001 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DesP31001 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DesP31001 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DesP31001 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DesP31001 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DesP31001 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DesP31001 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DesP31001 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DesP31001 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DesP31001 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0
DesP31001 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DesP31001 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
DesP31001 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DesP31001 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DesP31001 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DesP31001 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DesP31001 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DesP31001 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DesP31001 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DesP31001 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DesP31001 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DesP31001 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DesP31001 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DesP31001 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DesP31001 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DesP31001 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DesP31001 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
DesP31001 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DesP31001 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
DesP31001 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DesP31001 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DesP31001 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DesP31001 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DesP31001 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DesP31001 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DesP31001 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DesP31001 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
DesP31001 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DesP31001 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DesP31001 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DesP31001 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DesP31001 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DesP31001 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DesP31001 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DesP31001 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DesP31001 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
DesP31001 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DesP31001 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DesP31001 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DesP31001 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DesP31001 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DesP31001 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DesP31001 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DesP31001 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DesP31001 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DesP31001 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DesP31001 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DesP31001 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DesP31001 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DesP31001 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
DesP31001 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DesP31001 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DesP31001 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DesP31001 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DesP31001 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DesP31001 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DesP31001 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DesP31001 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DesP31001 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DesP31001 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DesP31001 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DesP31001 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DesP31001 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DesP31001 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DesP31001 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DesP31001 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DesP31001 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DesP31001 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DesP31001 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DesP31001 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DesP31001 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DesP31001 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DesP31001 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
DesP31001 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
DesP31001 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DesP31001 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.05■□□□□ -0
DesP31001 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.05■□□□□ -0
DesP31001 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DesP31001 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DesP31001 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.05■□□□□ -0
DesP31001 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms