Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pabpc1P29341 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pabpc1P29341 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pabpc1P29341 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pabpc1P29341 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pabpc1P29341 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pabpc1P29341 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Pabpc1P29341 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pabpc1P29341 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pabpc1P29341 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pabpc1P29341 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pabpc1P29341 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pabpc1P29341 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pabpc1P29341 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pabpc1P29341 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pabpc1P29341 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pabpc1P29341 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Pabpc1P29341 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Pabpc1P29341 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Pabpc1P29341 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Pabpc1P29341 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Pabpc1P29341 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pabpc1P29341 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pabpc1P29341 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pabpc1P29341 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pabpc1P29341 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pabpc1P29341 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pabpc1P29341 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pabpc1P29341 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pabpc1P29341 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pabpc1P29341 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pabpc1P29341 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pabpc1P29341 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pabpc1P29341 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pabpc1P29341 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pabpc1P29341 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pabpc1P29341 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pabpc1P29341 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pabpc1P29341 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pabpc1P29341 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pabpc1P29341 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pabpc1P29341 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pabpc1P29341 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pabpc1P29341 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pabpc1P29341 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pabpc1P29341 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pabpc1P29341 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pabpc1P29341 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pabpc1P29341 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Pabpc1P29341 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Pabpc1P29341 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pabpc1P29341 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pabpc1P29341 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Pabpc1P29341 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pabpc1P29341 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pabpc1P29341 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pabpc1P29341 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pabpc1P29341 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pabpc1P29341 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pabpc1P29341 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pabpc1P29341 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pabpc1P29341 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pabpc1P29341 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pabpc1P29341 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pabpc1P29341 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pabpc1P29341 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pabpc1P29341 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pabpc1P29341 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pabpc1P29341 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pabpc1P29341 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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