Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RxrgP28705 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RxrgP28705 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RxrgP28705 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RxrgP28705 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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