Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RxraP28700 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RxraP28700 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RxraP28700 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RxraP28700 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RxraP28700 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RxraP28700 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RxraP28700 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RxraP28700 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RxraP28700 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RxraP28700 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RxraP28700 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RxraP28700 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RxraP28700 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RxraP28700 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RxraP28700 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RxraP28700 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RxraP28700 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RxraP28700 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RxraP28700 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RxraP28700 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RxraP28700 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RxraP28700 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RxraP28700 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RxraP28700 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RxraP28700 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RxraP28700 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RxraP28700 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RxraP28700 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RxraP28700 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RxraP28700 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RxraP28700 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RxraP28700 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RxraP28700 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RxraP28700 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RxraP28700 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RxraP28700 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RxraP28700 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RxraP28700 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RxraP28700 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RxraP28700 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RxraP28700 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RxraP28700 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RxraP28700 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RxraP28700 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RxraP28700 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RxraP28700 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RxraP28700 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RxraP28700 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RxraP28700 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RxraP28700 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RxraP28700 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RxraP28700 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RxraP28700 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RxraP28700 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RxraP28700 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RxraP28700 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RxraP28700 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RxraP28700 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RxraP28700 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RxraP28700 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RxraP28700 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RxraP28700 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RxraP28700 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RxraP28700 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RxraP28700 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RxraP28700 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RxraP28700 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RxraP28700 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RxraP28700 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RxraP28700 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RxraP28700 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RxraP28700 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RxraP28700 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RxraP28700 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RxraP28700 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RxraP28700 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RxraP28700 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
RxraP28700 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
RxraP28700 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RxraP28700 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RxraP28700 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RxraP28700 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RxraP28700 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RxraP28700 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
RxraP28700 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RxraP28700 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RxraP28700 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RxraP28700 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RxraP28700 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RxraP28700 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RxraP28700 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RxraP28700 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RxraP28700 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RxraP28700 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RxraP28700 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RxraP28700 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RxraP28700 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RxraP28700 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
RxraP28700 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
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