Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ChgaP26339 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ChgaP26339 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ChgaP26339 AC154849.3-201ENSMUST00000223733 1660 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ChgaP26339 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ChgaP26339 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChgaP26339 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ChgaP26339 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ChgaP26339 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ChgaP26339 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ChgaP26339 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ChgaP26339 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ChgaP26339 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ChgaP26339 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ChgaP26339 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ChgaP26339 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ChgaP26339 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ChgaP26339 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ChgaP26339 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ChgaP26339 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ChgaP26339 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ChgaP26339 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ChgaP26339 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ChgaP26339 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ChgaP26339 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ChgaP26339 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ChgaP26339 Gm25116-201ENSMUST00000157191 122 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ChgaP26339 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ChgaP26339 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms